W skład Miejskiego Obszaru Funkcjonalnego Torunia (MOFT) wchodzą następujące jednostki samorządu terytorialnego:
- Gmina Miasta Toruń
- Powiat Aleksandrowski wraz z gminami:
- Miasto Aleksandrów Kujawski
- Miasto Ciechocinek
- Miasto Nieszawa
- Gmina Aleksandrów Kujawski
- Gmina Bądkowo
- Gmina Koneck
- Gmina Raciążek
- Gmina Waganiec
- Gmina Zakrzewo
- Powiat Chełmiński wraz z gminami:
- Miasto Chełmno
- Gmina Chełmno
- Gmina Unisław
- Gmina Kijewo Królewskie
- Gmina Stolno
- Gmina Papowo Biskupie
- Gmina Lisewo
- Powiat Golubsko–Dobrzyński wraz z gminami:
- Miasto Golub-Dobrzyń
- Gmina Golub-Dobrzyń
- Gmina Ciechocin
- Gmina Radomin
- Gmina Zbójno
- Miasto i Gmina Kowalewo Pomorskie
- Powiat Toruński wraz z gminami:
- Miasto Chełmża
- Gmina Chełmża
- Gmina Czernikowo
- Gmina Lubicz
- Gmina Łubianka
- Gmina Łysomice
- Gmina Obrowo-
- Gmina Wielka Nieszawka
- Gmina Zławieś Wielka
